Налоговые споры

Налоговый комплаенс для среднего бизнеса в Казахстане

Налоговый комплаенс в Казахстане — это не разовая подготовка к проверке, а постоянная система контроля: правильный налоговый режим, своевременные декларации, корректные ЭСФ и документация по вычетам. С 2026 года Налоговый кодекс РК существенно изменил правила: новый порог НДС, повышенная ставка, расширенный запретительный список для упрощёнки и система e-Tamga. Это руководство — пошаговый план для среднего бизнеса, который хочет снизить налоговые риски и быть готовым к проверке КГД.

Фото Нурсултан Бекетов
Нурсултан Бекетов 13 августа 2026
11 мин

Если ваша компания не проходила налоговый аудит в 2026 году — самое время проверить риски до того, как это сделает КГД. Проверить налоговые риски · info@vetrovkz.com

Шаг 1. Определите актуальный налоговый режим

Выбор налогового режима — отправная точка комплаенса: от него зависят ставки, отчётность и допустимые вычеты. С 2026 года Налоговый кодекс РК сохранил три специальных налоговых режима (СНР): самозанятые (4%), упрощённая декларация (4%) и крестьянские фермерские хозяйства (0,5%). Для среднего бизнеса наиболее актуален выбор между упрощёнкой и общеустановленным режимом (ОУР).

Ключевое изменение 2026 года: расходы на закупки у плательщиков упрощёнки не принимаются на вычет по КПН для компаний на ОУР. Это означает, что ваши контрагенты на ОУР могут отказаться работать с вами, если вы применяете упрощёнку. Проверьте, не попала ли ваша деятельность в расширенный запретительный список — с 2026 года он охватывает более 185 видов деятельности по ОКЭД, включая юридические и бухгалтерские услуги.

Срок для выбора или смены режима — до 1 марта 2026 года. Если вы пропустили этот срок, компания автоматически остаётся на действующем режиме до следующего периода. Проверьте соответствие режима фактической деятельности — несоответствие создаёт риск доначислений при проверке КГД.

  • Упрощённая декларация: ставка 4%, ограниченный перечень ОКЭД, нет вычетов по расходам
  • ОУР: КПН 20% с чистой прибыли, полноценный НДС-учёт, вычеты по документально подтверждённым расходам
  • Запретительный список для упрощёнки: проверить по актуальному перечню ОКЭД в Налоговом кодексе РК

Шаг 2. Проверьте обязательства по НДС

Порог обязательной регистрации по НДС в Казахстане с 2026 года составляет 10 000 МРП — 43 250 000 тенге (по состоянию на 2026 год). Это вдвое ниже прежнего порога в 20 000 МРП. Если оборот вашей компании приближается к этой отметке, необходимо заблаговременно встать на учёт по НДС.

Базовая ставка НДС с 2026 года — 16% (ранее 12%). Для медикаментов действует льготная ставка 5% в 2026 году с повышением до 10% с 2027 года. Повышение ставки напрямую влияет на ценообразование и маржинальность — пересмотрите договорную базу с учётом новых ставок.

Система e-Tamga в режиме реального времени сопоставляет выставленные ЭСФ с декларациями по НДС. Любое расхождение автоматически фиксируется и может стать основанием для камеральной проверки. Убедитесь, что ваша учётная система корректно формирует ЭСФ и синхронизирована с требованиями e-Tamga.

Если ваш оборот приближается к порогу НДС или вы не уверены в корректности ЭСФ — лучше проверить сейчас, чем объяснять расхождения при проверке КГД.

Проверить налоговые риски

Шаг 3. Выстройте документооборот по вычетам

Вычеты по КПН — главная зона риска при выездной проверке КГД: именно здесь чаще всего возникают доначисления. Налоговый кодекс РК требует документального подтверждения каждого расхода, принимаемого на вычет. Отсутствие первичных документов автоматически означает отказ в вычете.

Для среднего бизнеса критически важны три категории документов: договоры с контрагентами, акты выполненных работ (оказанных услуг) и ЭСФ. Все три должны быть согласованы между собой — расхождения в датах, суммах или наименованиях услуг создают риск переквалификации расхода. Особое внимание — к платежам нерезидентам: управленческие услуги, роялти, проценты по займам требуют дополнительной документации по трансфертному ценообразованию.

Установите внутренний регламент хранения документов. Срок хранения первичных документов определён Налоговым кодексом РК — убедитесь, что архив охватывает весь период, открытый для проверки КГД. Электронные документы должны быть доступны для выгрузки в форматах, принимаемых налоговым органом.

  • Договор + акт + ЭСФ — минимальный пакет по каждой операции
  • Платежи нерезидентам — дополнительная документация по трансфертному ценообразованию
  • Электронный архив — доступность для выгрузки при проверке

Шаг 4. Настройте мониторинг рисков через СУНР

СУНР (система управления налоговыми рисками) заменила СУР с 2026 года и стала основным инструментом КГД для отбора компаний на проверку. Система присваивает каждому налогоплательщику категорию риска — низкую, среднюю или высокую — на основе анализа ЭСФ, деклараций и банковских данных.

Компании с высокой категорией риска попадают в план проверок приоритетно. Снизить категорию риска можно конкретными действиями: своевременная подача деклараций без корректировок, отсутствие расхождений между ЭСФ и декларациями, стабильная налоговая нагрузка без резких колебаний. Резкое снижение налоговой нагрузки по сравнению с предыдущими периодами — один из ключевых триггеров для СУНР.

Рекомендуется ежеквартально проводить внутреннюю сверку: сопоставлять данные из учётной системы с данными в Кабинете налогоплательщика на сайте КГД. Расхождения лучше устранять самостоятельно до того, как их зафиксирует СУНР.

Шаг 5. Подготовьтесь к проверке КГД заблаговременно

Выездная проверка КГД — не внезапное событие: как правило, ей предшествуют камеральный контроль, запросы пояснений и уведомления через Кабинет налогоплательщика. Налоговый кодекс РК устанавливает ограниченные сроки для проведения выездной проверки. Готовность к ней — вопрос постоянного поддержания порядка в документах, а не авральной подготовки.

Ключевые элементы готовности к проверке: актуальный реестр договоров с контрагентами, полный архив ЭСФ за проверяемый период, сверка расчётов с бюджетом без задолженностей, документация по трансфертному ценообразованию (если применимо). Отдельно проверьте корректность исчисления и удержания ИПН с сотрудников — это стандартный раздел любой выездной проверки.

По итогам проверки КГД составляет акт. У компании есть 30 дней для подачи возражений — этот срок нельзя пропустить. По нашему опыту, качественные возражения на стадии проверки существенно влияют на итоговую сумму доначислений и исход последующего обжалования.

  • Реестр договоров и актов — актуальный, с возможностью быстрой выгрузки
  • Сверка с бюджетом — без задолженностей и переплат
  • 30 дней на возражения после получения акта — срок пресекательный

Получили уведомление КГД или акт проверки — у вас 30 дней на возражения. Промедление сужает возможности для обжалования.

Подготовить возражения на акт

Что делать, если проверка уже началась?

Если КГД уже приступил к проверке, первое действие — уведомить юриста и назначить ответственного сотрудника для взаимодействия с проверяющими. Не следует предоставлять документы и пояснения без предварительного анализа — каждый переданный документ становится частью доказательной базы.

В ходе проверки налоговый орган вправе запрашивать документы, проводить опросы сотрудников и осматривать помещения. Все запросы должны быть зафиксированы письменно. Устные пояснения без документального подтверждения создают риски — настаивайте на письменном формате взаимодействия.

Параллельно с проверкой проведите собственный анализ спорных эпизодов: соберите документы, которые подтверждают правомерность вычетов и операций. Это позволит подготовить обоснованные возражения на акт в установленный 30-дневный срок. Если сумма доначислений значительна — рассмотрите привлечение налогового юриста уже на стадии проверки, а не после получения акта.

Направление практики

Налоговые споры — сопровождение налоговых проверок КГД, подготовка возражений на акт, обжалование доначислений в административном и судебном порядке, консультации по новому Налоговому кодексу РК 2026 года.

Частые вопросы

1. Как стать налоговым резидентом Казахстана?

Налоговым резидентом Казахстана признаётся физическое лицо, фактически находящееся на территории страны не менее 183 дней в любом последовательном 12-месячном периоде. Для участников МФЦА предусмотрен сокращённый порог — 90 дней при соответствии условиям инвестиционного налогового резидентства. Юридическое лицо признаётся резидентом, если оно зарегистрировано в Казахстане или фактически управляется с территории страны. Статус резидента определяет, где и по каким ставкам уплачиваются налоги, а также применимость соглашений об избежании двойного налогообложения.

2. Какие налоговые льготы действуют в МФЦА?

Участники МФЦА пользуются нулевыми ставками по корпоративному подоходному налогу, НДС и налогу на дивиденды — по состоянию на 2026 год эти льготы закреплены до 1 января 2066 года. Льготы распространяются на деятельность, прямо предусмотренную Конституционным законом о МФЦА и AIFC Acts. Для получения льгот компания должна быть зарегистрирована в реестре МФЦА и вести деятельность в рамках разрешённых видов. Льготы не применяются автоматически — необходимо соответствие требованиям по структуре и характеру деятельности.

3. Что такое e-Tamga и как она работает?

e-Tamga — система автоматизированного контроля выписки электронных счетов-фактур (ЭСФ), введённая КГД МФ РК в рамках нового Налогового кодекса РК 2026 года. Система в режиме реального времени отслеживает соответствие выставленных ЭСФ задекларированным оборотам и сигнализирует о расхождениях. Для среднего бизнеса это означает, что любое несоответствие между ЭСФ и декларацией по НДС становится видимым налоговому органу практически мгновенно. Компаниям следует обеспечить синхронизацию учётных систем с требованиями e-Tamga во избежание автоматических уведомлений о нарушениях.

4. Какой порог обязательной регистрации по НДС?

По состоянию на 2026 год порог обязательной постановки на учёт по НДС в Казахстане составляет 10 000 МРП, что равно 43 250 000 тенге. Это значение снижено по сравнению с предыдущим порогом в 20 000 МРП — изменение введено Налоговым кодексом РК 2026 года. При достижении порога оборота по реализации товаров, работ или услуг за календарный год компания обязана подать заявление о постановке на учёт по НДС. Добровольная регистрация возможна и до достижения порога — это может быть выгодно при работе с контрагентами-плательщиками НДС.

5. Чем отличается упрощёнка от общеустановленного режима?

Упрощённая декларация (СНР) предполагает уплату единого налога по ставке 4% от дохода без учёта расходов, тогда как общеустановленный режим (ОУР) предусматривает уплату КПН по ставке 20% от налогооблагаемого дохода с правом вычета подтверждённых расходов. С 2026 года расходы на закупки у поставщиков на упрощёнке не принимаются на вычет по КПН для компаний на ОУР — это существенно влияет на выбор контрагентов. Кроме того, для упрощёнки действует запретительный список из более чем 185 видов деятельности по ОКЭД. Средний бизнес с оборотом выше порога НДС, как правило, работает на ОУР.

6. Какие сроки давности по налоговым проверкам в Казахстане?

Налоговый кодекс РК устанавливает ограниченный период, за который КГД вправе проводить проверку и доначислять налоги. Как правило, проверке подлежат налоговые периоды в пределах срока исковой давности, установленного налоговым законодательством. Для среднего бизнеса это означает необходимость хранения первичной документации, регистров учёта и ЭСФ в течение всего срока давности. Уничтожение документов до истечения этого срока создаёт риск невозможности подтвердить правомерность вычетов при проверке.

7. Как подготовить возражения на акт налоговой проверки?

После получения акта налоговой проверки у налогоплательщика есть 30 дней на подачу письменных возражений в КГД МФ РК. Возражения должны содержать конкретные ссылки на первичные документы, подтверждающие правомерность позиции компании по каждому спорному эпизоду. Эффективные возражения строятся по принципу «эпизод — норма — доказательство»: для каждого доначисления указывается правовое обоснование и прилагаются подтверждающие документы. Если сумма доначислений значительна, рекомендуется привлечь налогового юриста для подготовки возражений — ошибки на этой стадии сужают возможности при последующем обжаловании.

8. Нужно ли среднему бизнесу вести трансфертное ценообразование?

Правила трансфертного ценообразования в Казахстане применяются к сделкам между взаимосвязанными сторонами и к международным сделкам. Если средний бизнес совершает операции с аффилированными компаниями — в том числе с нерезидентами — он обязан обеспечить соответствие цен рыночному уровню и документально подтвердить это. Налоговый кодекс РК предусматривает обязанность представления отчётности по трансфертному ценообразованию при превышении установленных порогов. Несоблюдение требований может привести к корректировке налоговой базы и доначислению КПН.

9. Какие риски несёт директор за налоговые нарушения компании?

Руководитель компании в Казахстане несёт персональную ответственность за организацию налогового учёта и своевременную уплату налогов. При выявлении уклонения от уплаты налогов в крупном размере — свыше 50 000 МРП, что составляет 216 250 000 тенге по состоянию на 2026 год — возможно возбуждение уголовного дела по Уголовному кодексу РК. Административная ответственность наступает за менее значительные нарушения: несвоевременную подачу деклараций, непостановку на учёт по НДС, непредставление документов по запросу КГД. Директору следует обеспечить документальное подтверждение того, что решения принимались на основании рекомендаций бухгалтерии и внешних консультантов.

10. Как выбрать между СНР и общеустановленным режимом в 2026 году?

Выбор налогового режима зависит от трёх факторов: вид деятельности, годовой оборот и структура расходов. Если деятельность компании входит в запретительный список из более чем 185 видов ОКЭД — упрощёнка недоступна, и единственный вариант — ОУР. Если оборот приближается к порогу НДС в 43 250 000 тенге (по состоянию на 2026 год) или превышает его — ОУР, как правило, экономически обоснован. Срок выбора СНР на 2026 год — до 1 марта; после этой даты изменить режим в текущем году нельзя.

Выводы

Налоговый комплаенс для среднего бизнеса в Казахстане в 2026 году — это не формальность, а система управления рисками. Новый Налоговый кодекс РК снизил порог НДС, ввёл прогрессивную шкалу ИПН, ужесточил контроль через e-Tamga и ограничил вычеты по закупкам у поставщиков на упрощёнке. Каждое из этих изменений требует пересмотра учётных процессов и договорной работы.

Три приоритета: выстроить внутренний контроль ЭСФ и деклараций, провести аудит контрагентов на предмет их налогового режима и подготовить документальную базу для возможной проверки КГД. Компании, которые выстраивают комплаенс проактивно, тратят на споры с налоговым органом в разы меньше ресурсов.

Актуально на: 13 августа 2026 г.

Если налоговая нагрузка вызывает вопросы — разберёмся в деталях.

Право-300 · Best Lawyers · 1000+ дел с 2009 года

Смежные направления